Некоторым больным противопоказана транспортировка не только общественным транспортом, но даже городским такси, а также обычным поездом или самолетом. Это бывает связано не только со сниженным иммунитетом. Больные дети могут быть в очень тяжелом, ослабленном состоянии, когда они с трудом передвигаются или совсем перестают ходить. Некоторым из них в ходе транспортировки необходим медицинский контроль. Такие пациенты нуждаются в специальном медицинском транспорте, и фонд помогает решить эту проблему.

Кроме того, пациенты Московского областного онкологического диспансера (МООД) должны постоянно ездить в Балашиху из всех районов Московской области. Далеко не у всех семей есть личный автомобиль, поэтому Фонд часто оплачивает пациентам МООД услуги такси.

В 2017 году транспортные расходы фонда составили 5,2 млн рублей.