Некоторым больным противопоказана транспортировка не только общественным транспортом, но даже городским такси, а также обычным поездом или самолетом. Это бывает связано не только со сниженным иммунитетом. Больные дети могут быть в очень тяжелом, ослабленном состоянии, когда они с трудом передвигаются или совсем перестают ходить (в первую очередь это подопечные паллиативного проекта). Некоторым из них в ходе транспортировки необходим медицинский контроль. Такие пациенты нуждаются в специальном медицинском транспорте, и фонд помогает решить эту проблему.

В 2018 году транспортные расходы фонда составили 4,4 млн рублей.